DERECE PROGRAMLARI  Ön Lisans Derecesi  Lisans Derecesi  Yüksek Lisans Derecesi

Ders Bilgileri Dersin Adı : Mikolojide Biyoteknolojik Yöntemlerin Kullanılması Dersin Kodu : BK-567 Dersin Türü : Seçmeli Dersin Aşaması : İkinci Aşama (Yüksek Lisans) Dersin Yılı : 1 Dersin Dönemi : Güz (16 Hafta) Dersin AKTS Kredisi : 6 Eğitici(ler)nin Adı : Prof.Dr. MUKADDES KAYIM Dersin Öğrenme Kazanımları : Bitki patojen fungus kültürlerini hazırlamada kullanılan temel ve spesifik besi ortamlarını öğrenir Bitki patojen funguslardan nükleik asit izolasyonunu öğrenir Bitki patojen funguslarda sınıflandırmada kullanılan moleküler yöntemleri öğrenir Bitki patojen funguslarda sınıflandırmada kullanılan genleri ve fonksiyonlarını öğrenir Bitki patojen fungusların filogenetiğini kullanmayı ve klasik yöntemlerle birleştirmeyi öğrenir Bitki patojen fungusların klasik ve moleküler tekniklere göre sınıflandırmayı ve karşılaştırmayı öğrenir Dersin Veriliş Şekli : Örgün (Yüz Yüze) Dersin Önkoşulları : BK-501 Canlılarda Enerji Mekanizması Ders Hakkında Önerilen Diğer Hususlar : Yok Dersin Amacı : Kültür bitkilerinde hastalık etmeni olan funguslarda kullanılan biyoteknolojik yöntemleri öğretmek, moleküler tanılanmalarında kullanılan genleri, PCR temelli yöntemleri, filogenetik analizleri ve sonuçları moleküler ve geleneksel yöntemlerle (morfolojik ve fizyolojik) karşılaştırmak Dersin İçeriği : Fungus aleminin tanıtılması, sınıflandırılması, hastalıklı bitki dokusundan saflaştırılan fungusların moleküler karakterizasyonu, filogenetik analizi, gen gruplarına göre sınıflandırılması, biyoteknolojik yöntemlerin uygulanma alanları ve metodları Dersin Dili : Türkçe Dersin Yeri : Derslik,Laboratuvar   Ders Planı Hafta Konu Öğrencinin Ön Hazırlığı Öğrenme Aktiviteleri ve Öğretme Yöntemleri 1 Bitki patojen fungusların genel özellikleri Ders notu ve Kaynaklar Görsel 2 Bitki patojen fungusların klasik sınıflandırılması Ders notu ve Kaynaklar Görsel 3 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan moleküler yöntemlere genel bakış-Ödevlerin verilmesi Ders notu, Laboratuvar çalışma sonuçları ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 4 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan Internal transcribed spacer (ITS) genleri Ders notu, Laboratuvar çalışma soınuçları ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulaması 5 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan Beta tubulin (TUB2) genleri Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 6 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan Elongation factor 1 Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 7 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan SSU ve LSU genleri Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 8 Ara sınav Ders notu ve Kaynaklar yazılı ve sözlü sınav 9 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan Actin (ACT), Calmodulin (CAL), Chitin syntase (CHS-1) genleri Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 10 Bitki patojen fungusların sınıflandırılmasında kullanılan Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) ve Glutamine synthase (GS) Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 11 Genlerin filogentik analizi-1 (Fungus bölümlerine göre) Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 12 Genlerin filogentik analizi-2 (Fungus bölümlerine göre) Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 13 Filogenetik analize göre sınıflandırma (örneklerle) Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulaması şeklinde 14 Funguslarda gen transferleri ve kullanma alanları Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 15 Ödevler hakkında tartışma ve ödevlerin sunumu Ders notu ve Kaynaklar Laboratuvar Uygulama ve Görsel 16/17 Yıl Sonu Sınavı Ders notu ve Kaynaklar Yazılı ve sözlü   Önerilen Kaynak ve Okumalar Kaynak Türü Kaynak Adı Ders Notu ve Kitaplar  Phylogenetic trees made easy 4th edit:on Barry G. ll 2011  A phylogenetic re-evaluation of Dothideomycetes: Conrad L. Schoch, Joseph W. Spatafora, H. Thorsten Lumbsch, Sabine M. Huhndorf, Kevin D. Hyde, Johannes Z. Groenewald and Pedro W. Crous (Eds). Studies in Mycology 64, 2009.  Colletotrichum: complex species or species complexes? Ulrike Damm, Paul F. Cannon and Pedro W. Crous (Eds.) Studies in Mycology 73, 2012. Diğer Kaynaklar  Introductory Mycology1996. C.J. Alexopoulos, C.W. Mims, M. Blackwell (Eds.)  Plant Pathology George N. Agrios 4th Edition 2004   Değerlendirme (Sınav) Yöntemleri ve Kriterleri Yarıyıl/Yıl İçi Değerlendirmeleri Sayısı Katkı Yüzdesi     Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) 1 70     Ödev/Proje/Diğer 8 30 Toplam 100 Yarıyıl/Yıl İçi Değerlendirmelerinin Başarıya Katkısı 40   Yarıyıl/Yıl Sonu Değerlendirmesi 100 Yarıyıl/Yıl Sonu Değerlendirmesinin Başarıya Katkısı 60 Toplam 100   Dersin Temel Öğrenme Kazanımlarına Katkısı No Temel Öğrenme Kazanımı Katkısı* 1 Temel bilim, genel ziraat mühendisliği, bitkisel üretimle ilgili temel konularda bilgi sahibi olur 5 2 Kültür bitkilerinde verim kaybına neden olan hastalık, zararlı ve yabancı otların biyolojisi, ekolojisi, sistematiği ve mücadele yöntemlerini öğrenir 5 3 Kültür bitkilerinde verim kaybına neden olan hastalık, zararlı ve yabancı otların tanısı, biyolojisi ve mücadelesini uygulamalı olarak öğrenir 4 4 Bitki koruma problemlerini kavrar, bilimsel yöntemlerle çözümü için gerekli beceriyi kazanır 5 5 Bitki koruma problemlerine karşı uygun mücadele yöntemlerini seçerek, pratikte doğru kullanımını sağlar 3 6 Laboratuvar kullanma, analiz yapma ve sonuçları değerlendirme, yorumlama ve rapor yazma becerisi kazanır 5 7 Gerekli teknolojileri kullanarak bilgiye ulaşır, bunları sentezleyerek sözlü sunumlar yapar 5 * Katkı düzeyleri 0 (yok) ve 5 (en yüksek) arasında ifade edilmiştir.   Öğrenci İş Yükü - AKTS Çalışmalar Sayısı Süresi (Saat) Toplam İş Yükü (Saat) Ders ile İlgili Çalışmalar     Ders (Sınav haftaları dahil değildir) 14 2 28     Sınıf Dışı Ders Çalışma (Ön çalışma, pekiştirme) 14 1 14 Değerlendirmeler ile İlgili Çalışmalar     Ödev, Proje, Diğer 8 10 80     Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) 1 10 10     Yarıyıl/Yıl Sonu/Final Sınavı 1 14 14 Toplam İş Yükü: 146 Toplam İş Yükü / 25 (s): 5.84 Dersin AKTS Kredisi: 6